马来西亚联邦政府和各州政府实行分税制，目前征税的主要种类包括所得税、房地产盈利税、进出口税、出口税、销售及服务税以及印花税。近两年来，受到新冠疫情的影响，马来西亚政府采取了多项措施来刺激经济发展，并为农业、制造业、高新技术企业等行业出台了不同的税收优惠政策。 这些税收优惠政策旨在鼓励企业扩大生产规模、提高产品质量并加强创新能力，同时也为个人提供更多减税优惠。此外，为吸引更多国内外投资，马来西亚政府还提供了广泛的投资奖励和税收优惠，以帮助企业降低成本并增强竞争力。 总之，马来西亚政府致力于通过税收优惠政策促进经济发展和保护人民的福利。
大多数进口货物需缴纳进口税，税率分从价税率和从量税率。近几年马来西亚已取消了多种原料、机械与零部件的进口税。马来西亚与东盟国家之间实行特惠关税，工业产品的进口税率为0-5%之间；与日本实行双边自由贸易协定框架下的进口税；与中国和韩国实行中国-东盟自贸区以及韩国-东盟自贸区的区域自由贸易协定框架下的进口税；与澳大利亚签订自由贸易协定，根据协定，马来西亚将减免自澳进口商品97%以上的关税。
马来西亚对包括原油、原木、锯材和原棕油等在内的资源性产品出口征收出口税。从价征收的出口税的税率范围为零至20%。
销售税、服务税是2个不同的税种。马来西亚希望联盟政府上台后推出的税务改革重点，即用销售及服务税（SST）取代此前的消费税（GST）。销售及服务税是单项税制，只对特定产品制造商和马来西亚特定服务行业收取。商品销售税的税率为10%，服务税则是6%。
居民公司指实际管理和控制机构在马来西亚的公司。居民公司和非居民公司均需就来源于马来西亚的收入纳税，来源于境外的收入无须在马来西亚纳税（除银行业、保险业、航空公司、船运公司以外）。
自2016年起，公司所得税税率降为24%，中小企业应纳税所得额在50万林吉特以下部分，税率为19%，50万林吉特以上部分，适用正常税率。石油公司38%，边际油田25%。非居民公司，税率24%，分公司利润汇回，不征税。
出售股权的利得不征税，出售不动产的利得缴纳资本利得税，税率0～30%。自2014年1月1日起，马来西亚公司采用单层税制，对公司股息不征税，对境内利息收入征税。企业经营亏损，可以无限期后转，但所有权发生重大变更除外。马来西亚对控股公司的费用扣除有限制，控股公司指以控制投资为主且总收入的80%以上来源于投资收益的公司。
马来西亚居民公司取得境外收入，不缴纳公司所得税。马来西亚外国税款抵免规定：对税收协定国实行限额抵免，对于非税收协定国，抵免限额限定在已纳外国税款的50%以内。无受控外国公司规定。
马来西亚有转让定价规则，纳税调整适用正常交易原则，交叉持股可以谈签预约定价。2018年1月1日起开始实行资本弱化规则。
马来西亚居民公司向非居民支付股利，不征收预提税。分支机构利润汇回，无预提税。居民公司向非居民支付利息，预提税15%；向非居民支付特许权、租金、合同支付、佣金和担保费等，预提税10%。
马来西亚已经与73个国家（或地区）签订了避免双重征税协定
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